李家坟村在中华人民共和国成立后建制成村。
村内有刘家坟、孙家坟、李家坟、白家坟四个小村落,先前均为附近村庄的庄头坟户,其中孙家坟、刘家坟属南玉河村,李家坟、白家坟属皂甲屯。
1954年底,在农业合作化运动中,村内四个小村落被整合为一个分社,后在人民公社化运动中又成为公社下的一个生产队,并加入西郊农场,为西郊农场二分场(上庄公社二大队)皂甲屯3队。
1985年上级批复在原皂甲屯3队基础上成立李家坟村委会,李家坟村成为独立村庄,但是在行政隶属关系上仍属西郊农场二分场(上庄村委会)下辖的自然村。
1998年西郊农场于上庄乡场乡分设,2001年李家坟村挂牌成立行政村级村委会,李家坟村升格成为中华人民共和国版图内的一个基层行政村。