元代称海屿，属闽县嘉登里，清末属闽县东南二区嘉登里。

民国设海屿保属琅岐保甲所管辖。

1950年成立海屿农民协会，属闽侯县第二区管辖，1952年为海屿乡，1958年为海屿大队，1968年为海屿革委会，1970年为海屿大队属连江县琅岐公社管辖，1976年为海屿属福州市郊区琅岐公社管辖，1984年海屿分设义湖、旗峰、雁昇、江滨四个村属福州市郊区琅岐镇管辖，1995年属福州市马尾区琅岐镇管辖，1997年四个村合并为海屿村属福州市马尾区琅岐镇。