建县前属政和县政和里十八都。

明景泰六年（1455年）建县后至清代分属寿宁县坊隅一、二、三图。

1934年设青竹岭联保处，驻地外韦村。

1937年撤消联保处设青竹岭乡，乡公所驻地南门坑底村，辖12个保。

1941年6月青竹岭乡改由县直辖。

1946年撤乡属鳌阳镇。

1949年7月寿宁县人民政府成立，8月分别属第一区（鳌阳）、第二区（斜滩）。

1958年6月归县直辖，9月设登峰公社，驻地岱阳村。

1959年3月撤销登峰公社。

1961年5月设4个小公社，属鳌阳区。

1965年7月设岱阳公社，辖10个大队。

1981年7月改称清源公社。

1984年社改乡设清源乡，辖14个行政村。

1990年增设余山岗、龟洋村，清源乡共辖16个行政村。

2017年9月19日，经福建省人民政府（闽政文【2017】318号）批复。

同意寿宁县撤销清源乡，设立清源镇。