明弘治十二年（1499年），四九镇属新宁县德行都。

民国时期，属于台山县第一区。

中华人民共和国成立后，属台山县第一区。

1957年，撤区设乡，把四九区分为五十乡和四九乡。

1958年1月，又把四九乡和五十乡合并为四九乡人民委员会。

1958年10月，实行政社合一，四九乡与附城乡合建“附城”公社。

1959年6月，析附城镇而置“四九公社”。

1980年，改为四九人民公社管理委员会。

1983年8月，改制为四九区公所，后有改称村委会。

1986年12月，四九区公所改制为四九镇人民政府。