先秦时期，龙门港镇属百越之地，秦始皇统一中国后，龙门港镇归属象郡所辖。

汉朝至晋朝，龙门港镇属交州合浦郡。

南朝末元嘉设末寿郡，梁代设安州。

唐武德五年（622年），改宁越郡为钦州总管府。

元代，改为钦州路。

明至清末，先后属安远县、钦州、钦县、钦州、钦州直隶州地。

民国时期，置龙门乡，属钦县。

1958年，龙门乡并入钦州公社。

次年6月，分设龙门公社。

1984年9月，龙门公社撤改为龙门乡，属钦州市。

1993年8月，龙门乡改为龙门镇。

1994年10月，龙门镇改属钦州市钦南区。