马家沟村村民委员会地域在明万历年间属郧阳府郧县土门村。

清嘉庆年间属郧县南乡火炉保。

民国29（1940年）属郧县十堰乡火炉保。

1950年属十堰区火炉乡马家沟村。

1956年农业合作社时隶属关系不变。

1958年人民公社时属十堰人民公社七里管理区马家沟大队，1961年管理区改为人民公社时，属七里人民公社马家沟大队。

1971年撤区并社属东风公社马家沟大队。

1981年东风公社更名土门公社属土门公社管辖。

1984年撤社设区建乡，属白浪区公所东沟乡管辖，同年9月马家沟大队更名马家沟村。

1987年东沟乡撤销，属汉江路街道办事处管辖。