1949年4月，为倪巷大队，徐甲大队，王巷大队三个大队。

1994年2月前，倪巷大队、徐甲大队、王巷大队三个独立的大队隶属于西阳乡。

1994年2月，西阳撤乡建镇，倪巷大队、徐甲大队、王巷大队三个大队隶属于西阳镇。

2000年倪巷大队、徐甲大队、王巷大队三个大队合并更名为倪巷村。

2000年1月3日，茅麓镇、西旸镇合并为茅麓镇，倪巷村隶属于茅麓镇。

2007年3月26日，茅麓镇成建制并入原薛埠镇，倪巷村隶属于薛埠镇。