1951年11月成立辽东省通化行政公署长白县马鹿沟区（第一区），1952年6月属辽东省长白县；1954年8月属吉林省通化专员公署长白县，1955年10月更名为长白县马鹿沟乡，1958年9月属吉林省通化地区专员公署长白朝鲜族自治县，1965年2月更名为长白朝鲜族自治县马鹿沟人民公社；1984年3月更名为长白朝鲜族自治县马鹿沟乡，1985年4月属浑江市长白朝鲜族自治县，1992年11月更名为浑江市长白朝鲜族自治县马鹿沟镇，1994年3月属白山市长白朝鲜族自治县，名称一直沿用至今。