清康熙三十年(1691)，富顺县区划为四乡八路，琵琶场保为在城乡下东路。

民国元年（1912）设琵琶团和杜快团。

民国二十三年（1934），琵琶团和杜快团合并为琵琶乡，自此正式成为一级基层乡级机关。

民国二十四年（1935年），琵琶乡改镇。

民国二十八年（1939）改称琵琶镇和杜快乡。

民国三十八年9月（1949）琵琶、杜快合称琵杜乡。

琵琶乡仍为一乡建制，1949年12月，县人民政府成立后，乡（镇）保甲制改为乡（镇）村组制，撤销琵杜乡分设为7个小乡，隶属14区，1955年11月，改属童寺区。

1956年，乡改公社。

1958年改称公社，隶属城郊区，1983年12月，公社改乡。

1995年9月，琵琶乡与杜快乡并为琵琶镇，同时撤销城郊区，直属县人民政府管辖。

2019年8月，将原万寿镇青山村、建国村、洞上村和安溪镇顺江村所属行政区域划归琵琶镇管辖。